当寺は親鸞聖人を宗祖と仰ぐ浄土真宗本願寺派に所属する寺です。
　当寺の「御旧跡略縁起」「天保由緒書」によりますと、往古は天台宗豊原三千坊の一宇で西潟の西芳寺と称したとあります。本願寺の八代目、蓮如上人が加賀越前の境の吉崎に滞在中、文明五年（１４７３）加賀の山中温泉ご入湯の途中、当菅谷村に立ち寄られました。上人は越前藤島の超勝寺より、国境の大内峠を越えて、当寺の前の石に腰を掛け休憩されました。
　当寺の住持と問答になり、上人は椿の杖を地面に刺し、私が説く弥陀の本願の教えは、善人も悪人もすべての者が必ず救われるという教えであり、これがまことならば、この杖の下から清水が湧き出るだろうといわれ、杖を抜くと清水が湧き出たと伝えています。その清水を蓮如清水・椿清水と名づけ今に伝えています。住持は直ちに上人に帰依し、上人から法名教願を授けられました。
　上人はこの折、一粒の梅の実を撒いて次の歌を添えられました。
　　　　撒きおきし一粒種に八房の
　　　　　　　実のらば弥陀の誓いとぞしれ
　実りにくい八房の梅、すなわち救われることの難しい煩悩具足の人間が救われることがあるならば、弥陀のご本願しかないとの仰せであろうと思われます。

境内の旧跡・・・・・○椿清水　　　　　 ○八房の梅　　　　　○お腰掛けの石　　　　　　　　　
本堂の宝物・・・・・○蓮如上人御影　 ○楷書六字名号　　○三方正面阿弥陀如来絵像
                      ○椿の御杖　　　　 ○水晶の念珠　等

　また、西潟の西芳寺について、寿永二年木曽義仲が上洛の軍を進め、篠原において合戦となり、その折平家の武将であった斎藤実盛の臣、須崎理左衛門が主君の菩提を弔うために、当菅谷の地に逃れ農夫に身を隠していたが、豊原寺に到り剃髪して徳性坊と称していたとの伝承もあります。
　

和暦	西暦	事　　　　　　　　　　　項	参　　　　　　　考
文明３	1471	蓮如上人　吉崎来錫・御坊建立
文明５	1473	蓮如上人山中温泉来錫当寺に立ち寄られる
		阿弥陀如来・蓮如上人御影・六字名号頂戴
		教願弟子となる	開基教願
文明７	1475	蓮如上人吉崎退出
明応９	1500	実如証判御文章	1500〜1525年間か
文禄元	1592	顕如上人真影
寛永１４	1637	寺号木仏御免
寛永１７	1640	蓮如上人真影裏書き御免	良如上人御改裏書き
康安２	1649	木仏寺号許可（願主教願）	裏書き良如花押
貞享元	1684	五帖御文章	寂如御判
貞享５	1687	鉄砲改め	教願
宝永２	1705	寺地拝領
享保５	1720	親鸞聖人御絵伝	寂如上人裏書き
明和元	1764	七高僧図・太子尊形	法如上人裏書き
天明３	1783	本堂再建
寛政７	1795	親鸞聖人真影	文如上人裏書き
天保４	1833	鐘楼堂建立・梵鐘寄進
天保６	1835	大門建立・天保由緒書き
嘉永２	1849	御領主立ち寄り
嘉永６	1853	本堂再建
明治１１	1878	明如上人御消息	菅谷惣同行中宛
昭和１７	1942	梵鐘仏具等供出
昭和４８	1948	梵鐘再鋳
昭和３１	1956	土蔵再建
昭和５８	1983	本堂屋根改修・書院新築
昭和５９	1984	即如門主来錫
平成１０	1998	本堂雪囲い新築
平成１５	2003	帳場増築・法中玄関改築
平成１７	2005	蓮如上人銅像建立